Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF40O75150 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF40O75150 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF40O75150 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF40O75150 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF40O75150 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms