Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP104O60308 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP104O60308 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms