Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms