Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB3O43889 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB3O43889 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3O43889 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3O43889 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.7 ms