Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP9O43818 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP9O43818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms