Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms