Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms