Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms