Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms