Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2AO43633 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms