Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms