Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP3O43295 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP3O43295 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP3O43295 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms