Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms