Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms