Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPEF2O14830 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms