Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
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