Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFRA2O00451 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GFRA2O00451 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFRA2O00451 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFRA2O00451 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA2O00451 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA2O00451 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA2O00451 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA2O00451 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA2O00451 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA2O00451 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms