Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms