Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP23O00161 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms