Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms