Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms