Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P5A8MQ11 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P5A8MQ11 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms