Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM88BA6NKF7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM88BA6NKF7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms