Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms