Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms