Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms