Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB19A4D1S5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms