Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM89A2RUT3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms