Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC5DA1L4H1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms