Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms