Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms