Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 NR1I3-223ENST00000506209 1441 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TULP3-202ENST00000448120 3076 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PRNT-202ENST00000418528 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 WISP1-202ENST00000250160 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FGFR2-209ENST00000369056 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZSCAN9-202ENST00000425468 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SLC25A52-201ENST00000269205 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RCAN1-204ENST00000399272 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NMNAT2-202ENST00000294868 5448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SNORA68B-201ENST00000364518 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FCAR-208ENST00000391726 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SLC25A6P6-201ENST00000404247 778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL031667.2-201ENST00000423903 323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FRY-AS1-201ENST00000428419 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL359555.1-201ENST00000437016 806 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPSAP28-201ENST00000437188 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ULBP3-202ENST00000438272 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPL5P1-201ENST00000460716 894 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RN7SL310P-201ENST00000465317 281 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPL3P6-201ENST00000474162 1204 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TCEAL4-212ENST00000494801 1008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC01322-203ENST00000496693 1075 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FANCD2OS-206ENST00000524279 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OR1D4-202ENST00000531680 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC100791.1-201ENST00000570408 324 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 U47924.3-201ENST00000610699 461 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SSX6-202ENST00000412590 1461 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC237221.2-201ENST00000624231 2537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PTPRD-207ENST00000463477 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DNM1P46-201ENST00000341853 3831 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GPR50-201ENST00000218316 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 EPHB2-203ENST00000374632 3677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DYRK4-211ENST00000540757 3272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ENO1P1-201ENST00000366587 1304 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 KNOP1P2-201ENST00000605379 1317 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GOLGA6L22-203ENST00000620691 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYBPC2-201ENST00000357701 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TEX47-201ENST00000297203 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AF241726.1-201ENST00000317902 699 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C10orf53-201ENST00000374111 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CCR3-203ENST00000395942 1201 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 U40455.1-201ENST00000411473 865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C1QTNF9-AS1-201ENST00000449656 470 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL133353.1-201ENST00000452391 303 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RFTN1P1-202ENST00000455527 996 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BPI-205ENST00000479646 383 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL553P-201ENST00000482215 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC02056-203ENST00000512573 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC01843-201ENST00000515627 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC105206.2-201ENST00000523556 515 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LYVE1-203ENST00000529598 936 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC02467-201ENST00000542804 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNASE12-201ENST00000556526 631 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LYSMD2-203ENST00000558126 775 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ARPP19-212ENST00000569281 661 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CKLF-CMTM1-205ENST00000615332 395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 VIPR1-AS1-229ENST00000628282 515 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SPRY4-IT1-201ENST00000630558 703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MROH7-203ENST00000395690 3413 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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