Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC245060.1-201ENST00000440829 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RNU7-92P-201ENST00000458830 76 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RNU7-173P-201ENST00000458903 76 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IGKV1-37-201ENST00000465170 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CCDC162P-207ENST00000473454 547 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL627309.2-201ENST00000493797 323 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC097460.1-202ENST00000507494 769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IGKV1D-37-201ENST00000509129 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC139365.1-201ENST00000519417 322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC009901.2-201ENST00000521595 240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP004607.8-201ENST00000526848 323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ARHGAP23P1-202ENST00000567025 423 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC009093.3-201ENST00000567688 351 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC125437.1-201ENST00000586389 714 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC126283.1-201ENST00000609440 364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL110115.2-201ENST00000611296 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL049794.1-201ENST00000616572 774 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OR7G15P-201ENST00000617262 333 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.72-201ENST00000617458 278 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL583859.3-201ENST00000623982 1068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF544-220ENST00000627781 383 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SYNE1-203ENST00000354674 3154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TRPC2-201ENST00000451043 3173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC00488-201ENST00000494582 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC244034.3-201ENST00000624347 3135 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CDH18-202ENST00000382275 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ST8SIA6-AS1-201ENST00000377597 1811 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 BBS10-201ENST00000393262 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TTF1-203ENST00000612514 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OTUD6B-205ENST00000615618 3434 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MTCL1-207ENST00000518815 3963 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CATSPER2P1-204ENST00000439564 1579 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NBPF22P-202ENST00000590707 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 BBS4-202ENST00000395205 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC060780.1-203ENST00000634503 2406 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 KCTD7-207ENST00000639879 5098 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 KCNJ3-201ENST00000295101 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PIK3CD-AS1-201ENST00000377320 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FLT1P1-201ENST00000451650 1320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC01287-201ENST00000416982 2624 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 C15orf32-202ENST00000624458 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OR6Q1-201ENST00000302622 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 COLEC10-201ENST00000332843 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PROSER3-203ENST00000421853 650 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC103563.3-201ENST00000428055 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC024937.1-201ENST00000429793 344 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC004448.3-201ENST00000435953 543 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IFNWP15-201ENST00000442022 600 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL132838.1-201ENST00000469219 542 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 DUX4L51-201ENST00000508172 1109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MTND6P3-201ENST00000520612 542 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PROSER3-206ENST00000536950 1266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC012317.1-201ENST00000563611 534 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC132938.1-201ENST00000566971 360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MT1E-203ENST00000568293 332 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC009075.2-201ENST00000568483 301 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC006504.5-205ENST00000588318 432 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC025884.3-201ENST00000605422 343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC010335.2-201ENST00000623166 528 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CD36-208ENST00000433696 1985 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC01949-201ENST00000445770 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ACTG1P9-201ENST00000457622 2658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RBMX2-201ENST00000305536 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RBM44-202ENST00000409864 3449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MTFR1L-204ENST00000374307 1868 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CTSE-201ENST00000358184 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 EMP2-202ENST00000359543 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 BPNT1-203ENST00000414869 2357 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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