Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms