Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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