Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX9Q9Y5X1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms