Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms