Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF13Q9Y2Y9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms