Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAN1Q9Y2M0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAN1Q9Y2M0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms