Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms