Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms