Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms