Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms