Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZRN3Q9UPQ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms