Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4Q9UP95 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms