Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2AQ9ULE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms