Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms