Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACL1Q9UJ83 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms