Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN11AQ9UI33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms