Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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